- Barra de Santiago in Departamento de Ahuachapan
- Bocana El Sayte, an estuary in Departamento de Sonsonate
- Bocana de San Juan, a bay in Departamento de La Union
- El Faro in Departamento de La Union
- El Golandrino in Departamento de Ahuachapan
- El Huiscoyol in Departamento de Ahuachapan
- El Martillo in Departamento de Ahuachapan
- El Sunza in Departamento de Ahuachapan
- El Telpetate in Departamento de Ahuachapan
- El Ujushtal in Departamento de Ahuachapan
- Embarcadero de Guayapa in Departamento de Ahuachapan
- Estero Aleman, an estuary in Departamento de La Union
- Estero El Barraco, an estuary in Departamento de La Union
- Estero El Estampido, an estuary in Departamento de La Union
- Estero El Naranjal, an estuary in Departamento de La Union
- Estero El Zapote, an inlet in Departamento de Ahuachapan
- Estero La Bolsa, an inlet in Departamento de La Union
- Estero Torola, an inlet in Departamento de La Union
- La Angostura in Departamento de Ahuachapan
- La Cabana in Departamento de Ahuachapan
- La Gallinera in Departamento de La Union
- La Maquina in Departamento de Ahuachapan
- La Montanita in Departamento de Ahuachapan
- La Puebla in Departamento de Ahuachapan
- La Quesera in Departamento de Ahuachapan
- Las Conchas in Departamento de La Union
- Llano Grande in Departamento de Ahuachapan
- Lomas El Zope in Departamento de Ahuachapan
- Los Conacastes in Departamento de Ahuachapan
- Los Mangos in Departamento de Ahuachapan
- Manuel Jose Arce in Departamento de Ahuachapan
- Oceano Pacifico, an ocean
- Plan de La Negra in Departamento de La Union
- Puente Arce in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Aceituno, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Cacao, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Chaguite, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Corozal, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Garrobo, an intermittent stream in Departamento de Sonsonate
- Quebrada El Jutal, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Matadero, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Napoleon, an intermittent stream in Departamento de La Union
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- Quebrada El Pachotal, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Papalon, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Platanar, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Remolino, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Roble, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Telpetate, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada El Torno, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Verano, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada El Zapote, a stream in Departamento de La Union
- Quebrada La Angostura, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada La Barranca, a stream in Departamento de La Union
- Quebrada La Bruja, a section of stream in Departamento de La Union
- Quebrada La Lagartera, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada Laja Blanca, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada Las Palancas, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada Las Ventas, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada Los Canechos, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada Los Garcia, an intermittent stream in Departamento de Ahuachapan
- Quebrada Los Limones, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada Piedra Parada, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada de Cuevas, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada de Monteca, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Quebrada de Quiroz, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Rio Agua Fria, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Amolunca, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Chagalapa, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio El Bosade, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio El Imposible, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio El Riachuelito, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio El Sunza, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Guayapa, a section of stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Ishcanelo, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Maishtapula, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Miliano, an intermittent stream in Departamento de La Union
- Rio Mishtepe, a section of stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio Ojushte, a stream in Departamento de La Union
- Rio Sirama, a stream in Departamento de La Union
- Rio Tianmica, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio de Ashuquema, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Rio de Tacuba, a stream in Departamento de Ahuachapan
- Tegal in Departamento de Ahuachapan
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